make_ndxの追記方法
まさかの後輩から学ぶの巻。
自分で問題解決しようとする能力がある良い後輩ですね!
Gromacsでは何かとグループ選択画面が現れます。
ですが、デフォルトでは単純なものしか選べません。
(protein、SOL、sidechain などなど)
んで、そこそこ慣れるとデフォには無いグループを使いたくなります。
そんな時に使うのがmake_ndxコマンドですが、その使い方は省略。
今回は既にindexファイルがあって、そこに新しく項目を足したい!という話。
私は特に何も考えず毎回新規で作ってました……
でも後輩は大量のindexファイルに後から項目を付け足す必要がありました。
そんな時はとても簡単、-nで追記したいindexファイルを指定するだけ。
$ make_ndx -n index.ndx
分かれば単純だけど使わないと気付かないよね(言い訳)
ついでに、今覚えたMarkdown記法。 unixなどのコマンド系の表示をしたい時は半角4文字空けて書けばそれっぽい。
便利でかっこいいけど、はてな(っていうかブラウザ)上ではタブキー効かないし、不可視の半角が4個入ってるかよく分かんないのが微妙だなあ。